PDX data base – MBioLIMS


Modul-Bio développe des logiciels adaptés à votre activité pour suivre vos échantillons biologiques, intégrer des résultats d’expérience et diffuser des informations à des chercheurs. Notre logiciel est basé sur une architecture modulaire qui permet de répondre aux besoins spécifiques liés à votre activité. Le logiciel MBioLIMS possède une large gamme de modules permettant la gestion complète du cycle de vie des échantillons et de leurs données associées.

Dans le cadre du consortium IMODI, nous avons développé plusieurs modules adaptés à la collecte des données des différents partenaires. Ces modules sont les suivants :

  • Outil de caractérisation de la croissance tumorale.
  • Outil de caractérisation pharmacologique, pour enregistrer la réponse anti-tumorale aux drogues chez les modèles et les lignées cellulaires.
  • Base de données des patients, tumeurs, modèles PDX et lignées cellulaires in vitro/ex vivo avec la généalogie des échantillons et des modèles.
  • Enregistrement et affichage des données de génomique et transcriptomique.
  • Enregistrement des données d’immunohistochimie et d’infiltration tumorale des cellules immunitaires.
  • Enregistrement des données d’histopathologie.

Les modules dérivés du projet IMODI peuvent s’intégrer avec notre catalogue de modules existants pour créer un logiciel unique parfaitement adapté à votre activité.

Créée en 2003, Modul-Bio est une société spécialisée dans les solutions informatiques pour la gestion d’échantillons biologiques avec la mise en place de systèmes code-barres, de logiciels de gestion de données de laboratoire LIMS (Laboratory Information Management System) et d’outils collaboratifs pour le partage de collections d’échantillons biologiques.
Basée à Marseille sur le campus scientifique Luminy Biotech II, Modul-Bio ne cesse de croître et de déployer ses solutions en travaillant pour des Centres de Ressources Biologiques, des projets de cohortes nationales, des entreprises de biotechnologie et de cosmétologie et des laboratoires de diagnostic. Forte d‘une expertise alliant l’informatique à la biologie, l’entreprise a su s’imposer auprès de clients, industriels, hospitaliers ou académiques, principalement en France et en Europe.
Modul-Bio, qui vient tout juste de fêter ses dix ans d’existence, affiche un chiffre d’affaires en progression régulière et compte plus de 250 laboratoires utilisant ses solutions, la plaçant ainsi leader Français sur le marché des biobanques.
Dans le cadre du consortium IMODI, Modul-Bio sera chargée de la partie logiciel qui permettra d’enregistrer et de consulter les données collectées pour les 9 pathologies sélectionnées / correspondant aux 9 « runs ».

Le logiciel basé sur une architecture modulaire permettra de :

  • gérer les échantillons des 8 runs ;
  • récupérer les données des différentes sources (données clinico-pathologiques de l’outil e-CRF de BioFortis, données du microbiote) ;
  • mais aussi les oncogrammes de chaque modèle, enregistrer les caractéristiques histologiques, génomiques et transcriptionnelles, ainsi que les profils immunologiques des tumeurs et des modèles ;
  • enregistrer également les caractéristiques pharmacologiques des modèles.